ChemNet
 
Химический факультет МГУ

Я.И.Тихий, А.А.Кубасов, К.В.Ермаков

Квантово-химический расчет кластеров молекул воды.

Введение

Квантово-химическое моделирование поверхностных процессов, в частности, процессов адсорбции и каталитических процессов, требует от используемых методов возможности адекватно воспроизводить эффекты слабых межмолекулярных взаимодействий, таких как, например, водородные связи. Методы ab initio, такие как MP2 с использованием базисов с диффузными и поляризационными функциями, довольно хорошо отвечают данному требованию [10-12], но к сожалению мало пригодны для исследования подобных систем, так как из-за их размеров потребовалось бы чрезмерно большое количество времени и вычислительных ресурсов.

Разумной альтернативой может быть использование соответствующих полуэмпирических методов. Ранние полуэмпирические методы, такие как MINDO/3 и MNDO, сильно занижали энергию водородных связей, что делало их непригодными для исследования рассматриваемого класса систем [1, 2]. Позднее специально были разработаны методы AM1 [3] и PM3 [4], которые по замыслу создателей должны были успешно описывать системы с водородными связями. К сожалению, в случае AM1 это не удалось, и хотя рассчитанные AM1 значения энергии водородных связей довольно хорошо совпадают с таковыми, полученными экспериментально [5], предсказываемые AM1 геометрические параметры систем не соответствуют действительности, на что было указано в ряде работ [6, 13, 14].

Последний метод, PM3, оказался первой действительно удачной попыткой приблизить результаты полуэмпирических расчетов систем с водородными связями экспериментальным данным и результатам расчетов ab initio [6, 7].

Для проверки применимости методов для указанного класса задач оптимальным был бы расчет простой и изученной другими методами модели. Одной из таких моделей являются нейтральные олигомеры воды, которые, несмотря на то, что интерес к ним возник сравнительно недавно, уже хорошо изучены как экспериментально, так и теоретически и расчетными методами, причем в их случае часто квантово-химические расчеты идут впереди эксперимента, стимулируя и направляя его.

Методика расчетов

Полуэмпирические расчеты были произведены с помощью программы MOPAC 93 Revision 2 с полной оптимизацией геометрических параметров с гамильтонианами AM1 и PM3. Для оптимизации геометрии использовалась процедура BFGS (Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno) [5], так как более быстрая EF (eigenvector following) [5] не дала положительных результатов. Как оказалось, для достижения минимума в процедуре BFGS необходимо запретить использование алгоритма FSTMIN Тиля (Thiel) [9], так как этот алгоритм не гарантирует монотонного уменьшения энергии от итерации к итерации, и для исследуемых систем его использование приводит к зацикливанию в точке выше минимума энергии и невозможности его достижения.

Энергии образования олигомеров из мономера рассчитывались как разности энергии образования оптимальной структуры олигомера и соответствующего количества молекул мономера с оптимизированной тем же методом структурой:

DDHN = DHN - nDHH2O

и, соответственно, являются адиабатическими энергиями образования.

Результаты

Димер воды. - Расчет по методу AM1 дает структуру димера с симметрией C2V и двумя парами эквивалентных атомов водорода, очевидно, некорректную.

Расчет структуры анти-димера воды по методу PM3 дает геометрию, довольно точно согласующуюся с геометрией, полученной методом ab initio - длины водородной связи O-H и величины угла O-H-O практически совпадают. Результаты расчета анти-димера воды приведены в таблице 1.

Соответствующий син-изомер оказывается на 0.7 ккал/моль выше по энергии, но ему не соответствует минимум энергии - одна силовая постоянная оказывается орицательной. Как указано в [6], методы ab initio также не обнаруживают существования истинного син-изомера.

Энергии межмолекулярного взаимодействия различаются сильнее, чем геометрии, причем AM1 дает значение, практически равное экспериментальной величине -5.5 ккал/моль, а PM3 занижает энергию водородной связи. Правда, уместно будет заметить, что величина -5.1 ккал/моль в методе AM1 соответствует двум водородным связям, тогда как в димере воды фактически существует одна водородная связь, и следовательно, можно говорить о недооценке энергии водородной связи и в методе AM1, причем даже большей, чем в PM3.

    Таблица 1
    Свойство
    AM1
    PM3
    MP2/6-31G** [6]
    DHdim, ккал/моль
    -123.49
    -110.35
    -152.46
    DDHdim, ккал/моль
    -5.1
    -3.5
    -7.2
    Расстояние H...O, A
    2.2
    1.809
    1.956
    Угол O-H-O
    90'
    178.8'
    166.8'
    Нормальные частоты
  1. A..
  2. 103
    104
    97
  3. A'
  4. 119
    151
    147
  5. A''
  6. 219
    190
    164
  7. A'
  8. 432
    412
    204
  9. A'
  10. 481
    338
    421
  11. A''
  12. 678
    472
    659
  13. A'
  14. 1869
    1732
    1681
  15. A'
  16. 1953
    1736
    1715
  17. A'
  18. 3494
    3999
    3827
  19. A'
  20. 3503
    3860
    3884
  21. A'
  22. 3578
    3862
    3996
  23. A''
  24. 3583
    3988
    4015


Тример воды. - По экспериментальным данным тример воды имеет циклическую структуру с двумя видами окружения атомов водорода [8]. Геометрия, рассчитанная по методу AM1, оказывается очевидно неверной, с шестью эквивалентными атомами водорода и плоскостью симметрии, проходящей через атомы кислорода (точечная группа симметрии C3h).

Метод PM3 предсказывает существование двух различных неплоских структур, причем структура, имеющая группу симметрии C3, оказывается на 1.1 ккал/моль энергетически менее выгодной, чем несимметричный изомер (расчет ab initio по методу MP2/6-31G** дает для этой разности в энергиях значение 1.6 ккал/моль. [6])

В таблице 2 приведены численные значения свойств и геометрических параметров более устойчивого изомера тримера воды, полученные методами AM1 и PM3, а также результаты расчетов ab initio по методу MP2 в базисе 6-31G*, приведенные в [6]. Как следует из этих данных, значения геометрии и нормальных частот, полученные расчетом по методу PM3, довольно хорошо согласуются с таковыми, рассчитанными ab initio, хотя энергии образования тримера из элементов и из мономера отличаются довольно заметно.
Таблица 2
Свойство
AM1
PM3
MP2/6-31G* [6]
DHtrim, ккал/моль
-193.1
-170.35
-228.64
DDHtrim, ккал/моль
-15.5
-10.2
-23.7
Расстояние OЧЧЧH, A
2.198
1.796
1.88
Угол O-H-O
96.6'
148.5'
152.4'
Нормальные частоты
1
137
197
212
2
139
199
215
3
173
227
223
4
186
230
233
5
266
235
250
6
280
314
283
7
397
346
398
8
398
383
421
9
451
436
520
10
453
743
686
11
529
769
753
12
696
789
1058
13
1905
1706
1759
14
1905
1716
1768
15
1908
1719
1784
16
3484
3748
3511
17
3486
3780
3601
18
3486
3780
3606
19
3574
3967
3854
20
3575
3978
3856
21
3575
3978
3858

Тетрамер воды. - Подобно ab initio MP2 [6] метод PM3 предсказывает существование четырех близких по энергии изомеров тетрамера воды. Минимальная энергия у изомера симметрии C2.

Метод AM1, как и в случае меньших олигомеров, предсказывает неверную геометрию тетрамера, аналогичную геометрии тримера - с восемью эквивалентными атомами водорода и плоскостью симметрии, проходящей через атомы кислорода (группа симметрии С4h)
Таблица 3
Свойство
AM1
PM3
MP2/6-31G* [6]
DHtet, ккал/моль
-260.89
-232.06
-304.86
DDHtet, ккал/моль
-24.1
-18.5
-39.6
Расстояние HЧЧЧO, A
2.17
1.781
1.770
Угол O-H-O
99'
162.8'
168.6'

Общие замечания

Если рассчитать величины энергии, приходящейся на одну водородную связь, то получатся следующие значения (ккал/моль):
Таблица 4
Олигомер
AM1
PM3
MP2
димер
-2.5
-3.5
-7.2
тример
-2.6
-3.5
-7.9
тетрамер
-3.0
-4.6
-9.9

Основываясь на этих значениях, можно сделать предположение, что относительная устойчивость олигомеров возрастает одновременно с их размером, что в целом не является неожиданным, если учесть склонность воды к образованию сложных ассоциатов.

Авторы благодарны доктору J.J.P. Stewart и Fujitsu Limited, Tokyo, Japan, за предоставление возможности использования MOPAC 93.

Работа выполнена по проекту РФФИ 96-03 32343.

Литература

  1. I. H. Williams, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 6299.
  2. M. J. S. Dewar, W. J. Thiel, J. Am. Chem. Soc., 1977, 99, 4899.
  3. M. J. S. Dewar, E. G. Zoebisch, E. F. Healy, J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc., 1985, 107, 3902.
  4. J. J. P. Stewart, J. Comput. Chem., 1989, 209, 221.
  5. J. J. P. Stewart, MOPAC 93.00 Manual, Fujitsu Limited, Tokyo, 1993.
  6. H. S. Rzhepa, M. Yi, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2, 1990, 943.
  7. B. Kallies, R. Mitzner, J. Mol. Model., 1995, 1, 68.
  8. H. Kistenmacher, G. C. Lie, H. Popkie, E. Clementi, J. Chem. Phys., 1974, 61, 546.
  9. W. Thiel, J. Mol. Struct., 1988, 163, 415.
  10. S. M. Cybulski, S. J. Scheiner, J. Am. Chem. Soc., 1989, 111, 23.
  11. Z. Latajka, S. J. Scheiner, J. Phys. Chem., 1990, 94, 217.
  12. J. E. Del Bene, J. Chem. Phys., 1987, 86, 2110.
  13. S. Schroder, V. Daggett, P. Kollmann, J. Am. Chem. Soc., 1991, 113, 8922.
  14. M. W. Jurema, G. C. Shields, J. Comput. Chem., 1993, 14, 89.


Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается  копирование материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору