 |
|
|
13.МБ.101. Молекулярно-динамическое исследование бактериородопсина в пурпурной мембране
Molecular dynamics study of bacteriorhodopsin and the purple membrane. Baudry Jerome, Tajkhorshid Emad, Molnar Ferenc, Phillips James, Schulten Klaus. J. Phys. Chem. B. 2001. 105, № 5, с. 905–918. Англ.
Метод компьютерного моделирования сверхбыстрых молек. движений в молекуле бактериородопсина (БР) – с использованием данных кристаллографич. исследования БР и его фотоинтермедиатов – позволил не только локализовать молекулы воды в структуре данного мембранного белка, но и проследить их движение в ходе фотоцикла (в варианте теории возмущений свободной энергии, [Roux B. et al. Byophys J. 1996, V. 71, P. 670]). Действительно, после изомеризации остатка ретиналя "полностью транс – 13-цис" происходит замещение молекул воды БР – важнейшая стадия механизма действия "протонной помпы". Проведено интегрирование структур БР в общую модель пурпурной МБ: в результате получена модель процесса, связывающая внеклеточные молекулы воды с ее молекулами и ключевыми функциональными группами во внутримолек. полости БР: она позволяет полностью описать движение протона в процессе фотоцикла из внутри- во внемембранное пространство.
Ключевые слова: акк бактериородопсин% акк мембраны биологические% н пурпурные% акк вода% н локализация% акк фотоцикл% к молекулярное движение% акк протоны% н передвижение из МБ во внемембранное пространство% акк модели% н МБ и белка% акк молекулярной динамики метод
|
|
|
|
Для того, чтобы мы могли качественно предоставить Вам информацию, мы используем cookies, которые сохраняются на Вашем компьютере (сведения о местоположении; ip-адрес; тип, язык, версия ОС и браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник, откуда пришел на сайт пользователь; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; эта же информация используется для обработки статистических данных использования сайта посредством интернет-сервисов Google Analytics и Яндекс.Метрика). Нажимая кнопку «СОГЛАСЕН», Вы подтверждаете то, что Вы проинформированы об использовании cookies на нашем сайте. Отключить cookies Вы можете в настройках своего браузера.
Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается копирование
материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору
|
