|
Коллективная монография приурочена к 270-летию
Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова
и раскрывает одно из направлений исследований, развивающихся на
кафедре химической энзимологии в лаборатории экобиокатализа
Химического факультета МГУ. В монографии изложены подходы к
решению одной из современных проблем, связанных с необходимостью
управления и подавления биосистем, в состав которых входят
различные мицелиальные грибы и дрожжи. Развитие грибов в виде
монокультур, а также в составе полимикробных смешанных
консорциумов, в том числе устойчивых к воздействию различных
физико-химических факторов и проявляющих мультирезистентность к
лекарственным препаратам приводит к возникновению трудно
излечиваемых болезней у человека, животных, растений, поражению
сельскохозяйственных урожаев, порче продуктов питания, кормов,
развитию биокоррозии, метаногенных процессов, деградации
различных конструктивных материалов. Монография раскрывает
возможность подавления развития таких грибных биосистем и
связанных с ними процессов путём комбинирования ферментов с
антимикробными средствами, что позволяет получать новые варианты
антифунгальных препаратов со сниженными эффективными дозами и
токсичностью для нецелевых живых биообъектов. Книга будет
полезной для студентов, аспирантов, научных сотрудников,
специализирующихся в области медицинской, экологической,
промышленной энзимологии, биокатализа, молекулярной биологии,
биотехнологии, биоинформатики.
Авторы монографии:
Ефременко Е.Н., Асланлы А.Г., Степанов
Н.А.,
Сенько О.В., Домнин М.В., Лягин И.В., Маслова О.В.
|
Рецензенты:
профессор, доктор биологических наук
Худобин Виктор Васильевич (Первый МГМУ им. И.М.
Сеченова)
профессор, доктор биологических наук
Завьялова Наталья Васильевна (27 НЦ МО РФ) |
СОДЕРЖАНИЕ
| Предисловие |
|
11 |
| ГЛАВА 1. РАЗЛИЧНЫЕ ПРОТИВОГРИБКОВЫЕ
АГЕНТЫ КАК КАНДИДАТЫ ДЛЯ ВВЕДЕНИЯ В КОМПЛЕКСНЫЕ
ФЕРМЕНТ-СОДЕРЖАЩИЕ АНТИМИКРОБНЫЕ КОМБИНАЦИИ |
|
14 |
| 1.1. Антимикробные
полипептиды как противогрибковые агенты - кандидаты на
включение в состав комплексных препаратов с ферментами |
|
15 |
| 1.2. Анализ кандидатов
среди фунгицидовдля использования с ферментамив
антимикробных комбинациях |
|
34 |
| 1.3. Молекулы кворума и
ароматические спирты как кандидаты для комбинаций с
ферментамив антимикробных препаратах |
|
62 |
| 1.4. Вещества с
антиоксидантной активностью как потенциальные
противогрибковые агентыдля комбинаций с ферментами |
|
66 |
| 1.5. Различные
противогрибковые вещества неорганической природы из
числа металлсодержащих соединений, наноматериалов и
металлорганических каркасных соединений как кандидаты в
комбинации с ферментами |
|
76 |
| ГЛАВА 2. ФЕРМЕНТЫ ДЛЯ АНТИМИКРОБНЫХ
КОМБИНАЦИЙ ПРОТИВ ГРИБОВ И ОТБОР КАНДИДАТОВ |
|
123 |
| 2.1. Противогрибковые
ферменты, использующие в качестве субстратов клеточные
структурные компоненты грибов |
|
123 |
| 2.2. Ферменты,
гидролизующие грибковые белки с амилоидными свойствами |
|
134 |
| 2.3.Ферменты
гидролизующие микотоксины, антибиотики и кворумные
молекулы грибов |
|
139 |
| 2.4. Оценка in
silico и in vitro взаимодействий
ферментовс молекулами кворума грибов |
|
144 |
| 2.4.1.Компьютерное
моделирование взаимодействий ферментов, проявляющих
лактоназную активность,с молекулами кворума грибов |
|
144 |
| 2.4.2.Каталитические
характеристики ферментов, проявляющих лактоназную
активность по отношению к молекулам кворума грибов |
|
148 |
| 2.4.3.Исследование
противогрибковой активности ферментов, проявляющих
лактоназную активность |
|
150 |
| ГЛАВА 3. КОМБИНАЦИИ ФЕРМЕНТОВ С
АНТИМИКРОБНЫМИ АГЕНТАМИ |
|
168 |
| 3.1.Ферменты,
гидролизующие молекулы кворума,в антимикробных
комбинациях против бактерий |
|
170 |
| 3.2.Ферменты,
гидролизующие молекулы кворума,в антимикробных
комбинациях против грибов |
|
174 |
| 3.3. Компьютерное
моделирование ферментативных взаимодействий с
лактонсодержащими субстратами (молекулами кворума
грибов) в присутствии АМП |
|
180 |
| 3.4. Противогрибковое
действие АМП в отсутствие и в присутствии ферментов,
гидролизующихмолекулы кворума грибов |
|
182 |
| 3.5.Комбинация
противогрибковых ферментови наночастиц металлов |
|
189 |
| ГЛАВА 4. ПОДХОДЫ К СУПРЕССИИ
ПОЛИМИКРОБНЫХ КОНСОРЦИУМОВ, В СОСТАВ КОТОРЫХ ВХОДЯТ
КЛЕТКИ ГРИБОВ |
|
200 |
| 4.1.Различные соединения
и их комбинации против полимикробных консорциумов |
|
204 |
| 4.1.1. Влияние
непептидных антимикробных соединений растительного и
животного происхождения на смешанные консорциумы |
|
205 |
| 4.2.Антимикробные
пептиды (АМП) против полимикробных консорциумов |
|
211 |
| 4.3. Ингиоирование
полимикробных консорциумов коммерческими
противомикробными препаратамии органическими
растворителями |
|
215 |
| 4.4. Тяжелые металлы и
наночастицы (НЧ) против смешанных консорциумов
микроорганизмов |
|
224 |
| 4.5. Физико-химические
методы подавления полимикробных консорциумов |
|
229 |
| 4.1.Различные соединения
и их комбинации против полимикробных консорциумов |
|
204 |
| 4.1.1. Влияние
непептидных антимикробных соединений растительного и
животного происхождения на смешанные консорциумы |
|
205 |
| 4.2.Антимикробные
пептиды (АМП) против полимикробных консорциумов |
|
211 |
| 4.3. Ингиоирование
полимикробных консорциумов коммерческими
противомикробными препаратамии органическими
растворителями |
|
215 |
| 4.4. Тяжелые металлы и
наночастицы (НЧ) против смешанных консорциумов
микроорганизмов |
|
224 |
| 4.5. Физико-химические
методы подавления полимикробных консорциумов |
|
229 |
| 4.6.
Микробные клетки и их метаболиты как средство подавления
полимикробных консорциумов |
|
232 |
| 4.6.1. Ферменты как
антимикробные агенты для воздействия на полимикробные
консорциумы |
|
232 |
| 4.6.2. Кворумные
молекулы в регуляции полимикробных консорциумов |
|
237 |
| 4.6.3. Живые клетки
микроорганизмов и сложные смеси их метаболитов в
регуляции полимикробных консорциумов |
|
241 |
| 4.7. Вирусы в регуляции
функционирования консорциумов |
|
244 |
| 4.7.1. Бактериофаги |
|
244 |
| 4.7.2. Миковирусы как
агенты биологического контроля |
|
246 |
| 4.8.Анализ широко
распространенных полимикробных консорциумов с грибами и
подходов к их подавлениюи ликвидации |
|
251 |
| ГЛАВА 5. ФЕРМЕНТЫ В СОСТАВЕ
КОМБИНИРОВАННЫХ АНТИМИКРОБНЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ
ФУНКЦИОНАЛИЗАЦИИ РАЗЛИЧНЫХ МАТЕРИАЛОВ |
|
277 |
| 5.1. Вариации в составе
фермент-содержащих комбинаций |
|
280 |
| 5.2. Стабилизированные
формы ферментов в составекомбинированных
фермент-содержащих антимикробных препаратах |
|
292 |
| 5.3. Фермент-содержащие
антимикробные комбинациив составе тканевых материалов |
|
294 |
Монография приурочена к 270-летию
Московского государственного
университета имени М.В. Ломоносова
Предисловие
Данная монография является коллективным трудом,
который представляет научные результаты исследований
теоретического и прикладного характера, выполненные при
поддержке Россий ского научного фонда. Они проведены авторами,
являющимися со трудниками научно-исследовательской лаборатории
экобиокатализа кафедры химической энзимологии Химического
факультета МГУ имени М.В. Ломоносова, основное направление
деятельности кото рой напрямую связано с изучением свойств и
механизмов действия различных ферментов в различных областях
экологии. Здесь сле дует напомнить, что экология как наука,
изучает все вопросы, свя занные с взаимодействием различных
живых объектов между собой и с их средой обитания, а также
вопросы организации и функцио нировании биосистем различных
уровней (популяции, сообщества и экосистемы). И это определение
значительно шире того узкого восприятия, которое существует в
быту о том, что экология - это всего лишь состояние окружающей
среды, которая испытывает на себе воздействие именно
антропогенных факторов, определяющих необходимость постановки и
решения задач в области охраны окру жающей среды.
Понимание того, что помимо антропогенных
факторов сущест вуют источники других биотических воздействий, а
также изучение и понимание основных источников и принципов их
формирования, дает знание того, как эти воздействия можно
нивелировать и устра нять, чтобы создавать безопасные условия
для сосуществования разных живых объектов, сохраняя их
биоразнообразие на всех уров нях (геномов, популяций,
экосистем).
Представленные в монографии материалы
раскрывают основ ные подходы к управлению сложными
биологическими системами, в которых активными участниками
являются клетки разных ми кроскопических грибов. Сложность
управления такими система ми, в первую очередь, подавления их
развития в моногенных или смешанных высоко концентрированных
популяциях, заключается в том, что эти клетки являются
эукариотами, как клетки животных и растений. Они обладают
уникальными и разнообразными фер ментными биокатализаторами,
обеспечивающими грибам субстрат ное разнообразие. Они имеют
способность синтезировать антиби отики, микотоксины, пигменты и
другие соединения, дающие им преимущества в конкуренции за
выживание с бактериями и други ми эукариотическими клетками.
Одновременно с этим среди них есть симбионты, которые, как
показывает научный анализ, легко образуют полимикробные
консорциумы особенно с патогенными бактериальными культурами,
устойчивые к воздействию антими кробных средств.
Подход к супрессии микроскопических грибов,
ингибирова нию их метаболической активности и роста, перехода в
формы, более устойчивые к физико-химическим воздействиям, и в
первую очередь, к антимикробным агентам, который освещен в этой
моно графии, основан на применении ферментов в комбинации с
разны ми противомикробными средствами и позволяет создавать
совре менные антифунгальные препараты.
Выбор кандидатов для создания подобных
комбинаций не яв ляется случайным, и базируется на анализе
имеющихся данных о структуре и свойствах различных химических
соединений, про являющих антифунгальную активность, с одной
стороны, и ката литических характеристиках ферментов, с другой
стороны. Методы компьютерного моделирования межмолекулярных
взаимодействий позволяют оценить возможность негативных влияний
выбранных для комбинирования кандидатов друг на друга и
предсказать успеш ность ферментативного биокатализа по отношению
к разным суб стратам, в роли которых выступают целевые молекулы
(структур ные и функциональные) грибов.
Наиболее эффективно действующие комбинации
выявляются экс периментально на клетках мицелиальных грибов,
дрожжей, а также на полимикробных консорциумах, в состав которых
они входят. Подтвер ждённые успешные комбинации могут быть
введены в том числе в раз личные матрицы и носители с целью
создания разнообразных по форме и предназначению материалов с
антимикробными свойствами. Все эти аспекты отражены в данной
монографии.
Книга предназначена для широкого круга
специалистов в обла сти химической и инженерной, медицинской,
аналитической и эко логической энзимологии, для молодежи,
которая только начинает свой путь в науке, а также для ученых,
которые создают новые на правления развития российской науки и
видят дальнейшие перспек тивы её прогресса на основе достигнутых
результатов в исследо вании и применении ферментов в различных
областях (экологии, медицине, создании новых материалов,
сельском хозяйстве, живот новодстве, пищевой промышленности,
охране окружающей среды, разработке систем биозащиты).
Редактор -
профессор Е.Н. Ефременко
|