ChemNet
 
Химический факультет МГУ

Книги сотрудников факультета

Ферменты в антимикробных комбинациях против грибов :
монография / Е.Н. Ефременко, А.Г. Асланлы, Н.А. Степанов, О.В.Сенько, М.В. Домнин, И.В. Лягин, О.В. Маслова. - М.: Издательский дом «НАУЧНАЯ БИБЛИОТЕКА», 2024. - 308 с.ISBN 978-5-907823-59-4

Ферменты в антимикробных комбинациях против грибов

монография
под ред. проф. Ефременко Е.Н.
М.: Издательский дом «НАУЧНАЯ БИБЛИОТЕКА»,
2024. - 308 c.
ISBN 978-5-907823-59-4

Коллективная монография приурочена к 270-летию Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова и раскрывает одно из направлений исследований, развивающихся на кафедре химической энзимологии в лаборатории экобиокатализа Химического факультета МГУ. В монографии изложены подходы к решению одной из современных проблем, связанных с необходимостью управления и подавления биосистем, в состав которых входят различные мицелиальные грибы и дрожжи. Развитие грибов в виде монокультур, а также в составе полимикробных смешанных консорциумов, в том числе устойчивых к воздействию различных физико-химических факторов и проявляющих мультирезистентность к лекарственным препаратам приводит к возникновению трудно излечиваемых болезней у человека, животных, растений, поражению сельскохозяйственных урожаев, порче продуктов питания, кормов, развитию биокоррозии, метаногенных процессов, деградации различных конструктивных материалов. Монография раскрывает возможность подавления развития таких грибных биосистем и связанных с ними процессов путём комбинирования ферментов с антимикробными средствами, что позволяет получать новые варианты антифунгальных препаратов со сниженными эффективными дозами и токсичностью для нецелевых живых биообъектов. Книга будет полезной для студентов, аспирантов, научных сотрудников, специализирующихся в области медицинской, экологической, промышленной энзимологии, биокатализа, молекулярной биологии, биотехнологии, биоинформатики.



Авторы монографии:
Ефременко Е.Н., Асланлы А.Г., Степанов Н.А.,
Сенько О.В., Домнин М.В., Лягин И.В., Маслова О.В.


Рецензенты:
профессор, доктор биологических наук
Худобин Виктор Васильевич (Первый МГМУ им. И.М. Сеченова)
профессор, доктор биологических наук
Завьялова Наталья Васильевна (27 НЦ МО РФ)


СОДЕРЖАНИЕ

Предисловие      11
ГЛАВА 1. РАЗЛИЧНЫЕ ПРОТИВОГРИБКОВЫЕ АГЕНТЫ КАК КАНДИДАТЫ ДЛЯ ВВЕДЕНИЯ В КОМПЛЕКСНЫЕ ФЕРМЕНТ-СОДЕРЖАЩИЕ АНТИМИКРОБНЫЕ КОМБИНАЦИИ   14
   1.1. Антимикробные полипептиды как противогрибковые агенты - кандидаты на включение в состав комплексных препаратов с ферментами      15
   1.2. Анализ кандидатов среди фунгицидовдля использования с ферментамив антимикробных комбинациях      34
   1.3. Молекулы кворума и ароматические спирты как кандидаты для комбинаций с ферментамив антимикробных препаратах      62
   1.4. Вещества с антиоксидантной активностью как потенциальные противогрибковые агентыдля комбинаций с ферментами      66
   1.5. Различные противогрибковые вещества неорганической природы из числа металлсодержащих соединений, наноматериалов и металлорганических каркасных соединений как кандидаты в комбинации с ферментами      76
ГЛАВА 2. ФЕРМЕНТЫ ДЛЯ АНТИМИКРОБНЫХ КОМБИНАЦИЙ ПРОТИВ ГРИБОВ И ОТБОР КАНДИДАТОВ   123
   2.1. Противогрибковые ферменты, использующие в качестве субстратов клеточные структурные компоненты грибов      123
   2.2. Ферменты, гидролизующие грибковые белки с амилоидными свойствами      134
   2.3.Ферменты гидролизующие микотоксины, антибиотики и кворумные молекулы грибов      139
   2.4. Оценка in silico и in vitro взаимодействий ферментовс молекулами кворума грибов      144
   2.4.1.Компьютерное моделирование взаимодействий ферментов, проявляющих лактоназную активность,с молекулами кворума грибов      144
   2.4.2.Каталитические характеристики ферментов, проявляющих лактоназную активность по отношению к молекулам кворума грибов      148
   2.4.3.Исследование противогрибковой активности ферментов, проявляющих лактоназную активность      150
ГЛАВА 3. КОМБИНАЦИИ ФЕРМЕНТОВ С АНТИМИКРОБНЫМИ АГЕНТАМИ   168
   3.1.Ферменты, гидролизующие молекулы кворума,в антимикробных комбинациях против бактерий      170
   3.2.Ферменты, гидролизующие молекулы кворума,в антимикробных комбинациях против грибов      174
   3.3. Компьютерное моделирование ферментативных взаимодействий с лактонсодержащими субстратами (молекулами кворума грибов) в присутствии АМП      180
   3.4. Противогрибковое действие АМП в отсутствие и в присутствии ферментов, гидролизующихмолекулы кворума грибов      182
   3.5.Комбинация противогрибковых ферментови наночастиц металлов      189
ГЛАВА 4. ПОДХОДЫ К СУПРЕССИИ ПОЛИМИКРОБНЫХ КОНСОРЦИУМОВ, В СОСТАВ КОТОРЫХ ВХОДЯТ КЛЕТКИ ГРИБОВ   200
   4.1.Различные соединения и их комбинации против полимикробных консорциумов      204
   4.1.1. Влияние непептидных антимикробных соединений растительного и животного происхождения на смешанные консорциумы      205
   4.2.Антимикробные пептиды (АМП) против полимикробных консорциумов      211
   4.3. Ингиоирование полимикробных консорциумов коммерческими противомикробными препаратамии органическими растворителями      215
   4.4. Тяжелые металлы и наночастицы (НЧ) против смешанных консорциумов микроорганизмов      224
   4.5. Физико-химические методы подавления полимикробных консорциумов      229
   4.1.Различные соединения и их комбинации против полимикробных консорциумов      204
   4.1.1. Влияние непептидных антимикробных соединений растительного и животного происхождения на смешанные консорциумы      205
   4.2.Антимикробные пептиды (АМП) против полимикробных консорциумов      211
   4.3. Ингиоирование полимикробных консорциумов коммерческими противомикробными препаратамии органическими растворителями      215
   4.4. Тяжелые металлы и наночастицы (НЧ) против смешанных консорциумов микроорганизмов      224
   4.5. Физико-химические методы подавления полимикробных консорциумов      229
   4.6. Микробные клетки и их метаболиты как средство подавления полимикробных консорциумов      232
   4.6.1. Ферменты как антимикробные агенты для воздействия на полимикробные консорциумы      232
   4.6.2. Кворумные молекулы в регуляции полимикробных консорциумов      237
   4.6.3. Живые клетки микроорганизмов и сложные смеси их метаболитов в регуляции полимикробных консорциумов      241
   4.7. Вирусы в регуляции функционирования консорциумов      244
   4.7.1. Бактериофаги      244
   4.7.2. Миковирусы как агенты биологического контроля      246
   4.8.Анализ широко распространенных полимикробных консорциумов с грибами и подходов к их подавлениюи ликвидации      251
ГЛАВА 5. ФЕРМЕНТЫ В СОСТАВЕ КОМБИНИРОВАННЫХ АНТИМИКРОБНЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ФУНКЦИОНАЛИЗАЦИИ РАЗЛИЧНЫХ МАТЕРИАЛОВ   277
   5.1. Вариации в составе фермент-содержащих комбинаций      280
   5.2. Стабилизированные формы ферментов в составекомбинированных фермент-содержащих антимикробных препаратах      292
   5.3. Фермент-содержащие антимикробные комбинациив составе тканевых материалов      294


Монография приурочена к 270-летию
Московского государственного
университета имени М.В. Ломоносова

Предисловие

Данная монография является коллективным трудом, который представляет научные результаты исследований теоретического и прикладного характера, выполненные при поддержке Россий ского научного фонда. Они проведены авторами, являющимися со трудниками научно-исследовательской лаборатории экобиокатализа кафедры химической энзимологии Химического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова, основное направление деятельности кото рой напрямую связано с изучением свойств и механизмов действия различных ферментов в различных областях экологии. Здесь сле дует напомнить, что экология как наука, изучает все вопросы, свя занные с взаимодействием различных живых объектов между собой и с их средой обитания, а также вопросы организации и функцио нировании биосистем различных уровней (популяции, сообщества и экосистемы). И это определение значительно шире того узкого восприятия, которое существует в быту о том, что экология - это всего лишь состояние окружающей среды, которая испытывает на себе воздействие именно антропогенных факторов, определяющих необходимость постановки и решения задач в области охраны окру жающей среды.

Понимание того, что помимо антропогенных факторов сущест вуют источники других биотических воздействий, а также изучение и понимание основных источников и принципов их формирования, дает знание того, как эти воздействия можно нивелировать и устра нять, чтобы создавать безопасные условия для сосуществования разных живых объектов, сохраняя их биоразнообразие на всех уров нях (геномов, популяций, экосистем).

Представленные в монографии материалы раскрывают основ ные подходы к управлению сложными биологическими системами, в которых активными участниками являются клетки разных ми кроскопических грибов. Сложность управления такими система ми, в первую очередь, подавления их развития в моногенных или смешанных высоко концентрированных популяциях, заключается в том, что эти клетки являются эукариотами, как клетки животных и растений. Они обладают уникальными и разнообразными фер ментными биокатализаторами, обеспечивающими грибам субстрат ное разнообразие. Они имеют способность синтезировать антиби отики, микотоксины, пигменты и другие соединения, дающие им преимущества в конкуренции за выживание с бактериями и други ми эукариотическими клетками. Одновременно с этим среди них есть симбионты, которые, как показывает научный анализ, легко образуют полимикробные консорциумы особенно с патогенными бактериальными культурами, устойчивые к воздействию антими кробных средств.

Подход к супрессии микроскопических грибов, ингибирова нию их метаболической активности и роста, перехода в формы, более устойчивые к физико-химическим воздействиям, и в первую очередь, к антимикробным агентам, который освещен в этой моно графии, основан на применении ферментов в комбинации с разны ми противомикробными средствами и позволяет создавать совре менные антифунгальные препараты.

Выбор кандидатов для создания подобных комбинаций не яв ляется случайным, и базируется на анализе имеющихся данных о структуре и свойствах различных химических соединений, про являющих антифунгальную активность, с одной стороны, и ката литических характеристиках ферментов, с другой стороны. Методы компьютерного моделирования межмолекулярных взаимодействий позволяют оценить возможность негативных влияний выбранных для комбинирования кандидатов друг на друга и предсказать успеш ность ферментативного биокатализа по отношению к разным суб стратам, в роли которых выступают целевые молекулы (структур ные и функциональные) грибов.

Наиболее эффективно действующие комбинации выявляются экс периментально на клетках мицелиальных грибов, дрожжей, а также на полимикробных консорциумах, в состав которых они входят. Подтвер ждённые успешные комбинации могут быть введены в том числе в раз личные матрицы и носители с целью создания разнообразных по форме и предназначению материалов с антимикробными свойствами. Все эти аспекты отражены в данной монографии.

Книга предназначена для широкого круга специалистов в обла сти химической и инженерной, медицинской, аналитической и эко логической энзимологии, для молодежи, которая только начинает свой путь в науке, а также для ученых, которые создают новые на правления развития российской науки и видят дальнейшие перспек тивы её прогресса на основе достигнутых результатов в исследо вании и применении ферментов в различных областях (экологии, медицине, создании новых материалов, сельском хозяйстве, живот новодстве, пищевой промышленности, охране окружающей среды, разработке систем биозащиты).

Редактор -
профессор Е.Н. Ефременко


Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается  копирование материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору