М.Г. Хренова, Е.Д. Коц, А. М. Кулакова, И.В. Поляков

Моделирование реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе RasGAP

Сопоставлены результаты расчетов структур и энергий интермедиатов для реакции гидролиза гуанозинтрифосфата белковым комплексом Ras·GAP, полученные с помощью комбинации методов квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ) и фрагментных молекулярных орбиталей. Были подтверждены полученные ранее результаты, показывающие, что гидролиз связи P–O приводит к образованию фосфата H₂PO₄^– и имидной формы функциональной группы боковой цепи каталитического остатка Gln61.
Ключевые слова: GTP, Ras, GAP, ферментативный гидролиз.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2016, том 57, № 1, стр. 7-10