ChemNet
 
Вестник Московского Университета, серия "Химия"
Следующая статья Содержание  

А.А. Московский, И.А. Калиман, А.В. Акимов, С.С. Конюхов, Б.Л. Григоренко, А.В. Немухин

Реализация метода молекулярной динамики с жесткими фрагментами для моделирования химических реакций в биомолекулярных системах

Реферат

Описана новая реализация метода молекулярной динамики, направленного на моделирование свойств биомолекулярных систем, в которых могут происходить химические реакции. Для вычислений энергий и сил вдоль траекторий используется приближение квантовой и молекулярной механики на основе теории потенциалов эффективных фрагментов. В связи с особенностями метода эффективных фрагментов поведение молекулярно-механической подсистемы описывается при помощи динамики твердых тел. Методика применена для моделирования протонного транспорта вдоль молекул воды внутри канала грамицидина.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2007, том 48, № 4, стр. 219-222


Copyright (C) Химический факультет МГУ, 2007


Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается  копирование материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору