Я.И. Доброгорская, А.В. Немухин

Моделирование реакции ацилирования субстрата в активном центре сериновых протеаз

Квантово-химическими методами проведено моделирование стадии ацилирования реакции гидролиза пептидной связи, катализируемой сериновыми протеазами. Построение энергетической поверхности реакции для модельной системы и поиск стационарных точек (локальных минимумов и переходных состояний) проводились методом Хартри–Фока (ХФ) с применением псевдопотенциалов Стивенса–Баша–Краусса (СБК). Величины полученных энергетических барьеров пересчитаны с помощью теории функционала плотности в варианте B3LYP/6-31+G*. Полученные результаты удовлетворительно коррелируют с экспериментальными данными и уточняют детали механизма реакции ферментативного катализа.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2003, том 44, № 2, стр. 103-107