С. Д. Варфоломеев, А. Е. Пожитков

Активные центры гидролаз: основные типы структур и механизм катализа

Статья написана по материалам доклада на междисциплинарном семинаре “Координационная химия и катализ” сделанного 15 ноября 1999 г. В работе проведен анализ структур каталитических участков активных центров гидролаз – ферментов, наиболее хорошо представленных в структурных базах данных. Оказалось, что, несмотря на очень большое разнообразие типов субстратов, участвующих в каталитическом процессе, число типов структур активных центров весьма ограничено. Выявлено пять основных типов каталитических центров гидролаз. В каждом из типов активных центров можно идентифицировать два основных компонента каталитического процесса: нуклеофильный (или электрофильный) агент, активирующий воду и электрофильный активатор реакционного центра. Высказано и подтверждено предположение, что согласованное действие этих двух компонентов активного центра обеспечивает эффективность ферментативного катализа. Основные положения иллюстрируются детальным описанием механизмов катализа a-химотрипсином, папаином, карбоксипептидазой, лизоцимом, пепсином, рибонуклеазой, органофосфатгидролазой, уреазой, пирофосфатазой, рестриктазой, щелочной фосфатазой, галоидалкандегалогеназой.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2000, том 41, № 3, стр. 147-156